Han fikk sin første obo da han var ti. To år senere studerte Christoph Hartmann allerede sammen med Georg Fischer ved konservatoriet i Augsburg. I 1984 fortsatte han sin utdannelse under Günther Passin ved Musikkhøyskolen i München, der han etter å ha bestått den avsluttende eksamen også ble lærer. Han begynte sin karriere som orkestermusiker i 1991 med Stuttgart-filharmonien, og flyttet året etter til Berlin. Hartmann har vært lærer siden 1993 ved Berlinerfilharmoniens orkesterakademi, og i 1999 stiftet han sammen med kolleger Landsberger Sommermusiken, som senere utviklet seg til Ensemble Berlin.
I de senere år har han i økende grad viet seg til forskning, og har oppdaget og beriket sitt eget repertoar med den en gang så legendariske, men nå nesten glemte obovirtuosen Antonino Pasculli.